Strep-tag (Strep II Tag, AWRHPQFGG)

在这个亲和标签的发现和设计上，科学家还走过一些“弯路”。最初，他们发现了自然界中链霉亲和素 （streptavidin）和生物素（biotin）具有极强烈的非共价相互作用（non-covalent interactions），而且生物学上的解离常数（dissociation constant）非常低，数量级在10−14 mol/L左右；即使生物素和其他蛋白质共价结合之后，也不影响它和链霉亲和素的相互作用。基于这两者之间强烈的相互作用，科学家运用一系列蛋白质工程手段，通过对短肽文库的筛选，设计了第一个链霉亲和素结合肽标签-Strep-tag。但是Strep-Tag和链霉亲和素结合时需要一个自由的羧基末端，所以这个标签只能位于目标蛋白的Ｃ端，很大的限制了它的应用范围。在第一代标签的基础上，通过大量合成短肽的筛选，终于获得了一个和一代相似、也是由８个氨基酸（W-S-H-P-Q-F-E-K）组成的链霉亲和素结合肽，就是Strep-Tag II，它可以位于融合蛋白的任意一端，弥补了最初的不足 (Terpe, 2003)。